F&E-Vorhaben in Kooperation mit der Industrie führt die Professur über entsprechende Drittmittelverträge zwischen den auftraggebenden Unternehmen/Einrichtungen und der Universität der Bundeswehr durch. Diese werden durch die Verwaltung der Universität bzgl. z.B. Personaleinstellungen, Material-/Gerätebeschaffungen etc. begleitet. In den Projektkalkulationen sind hierfür und zur Nutzung der entsprechenden Uniressourcen sog. Overheads vorgesehen.
Unabhängig davon führt Professor Böttcher nicht-kommerzielle, freie Forschungs- und Studienaktivitäten in privater Bürogemeinschaft mit seinem Sohn Jakob Böttcher als "Wissenschaftliches Büro für intelligente technische Systeme Prof. Dr.-Ing. Jörg Böttcher" durch. Ein besonderer Fokus liegt hierbei auf der Gewinnung frei zugänglicher Technologien (Open Source) und dem fachlichen Austausch mit Forschung und Industrie im Vorprojektbereich. Primäres Ziel dabei ist es, Kooperationspartner aus dem industriellen bzw. staatlichen Umfeld hierüber für F&E-Drittmittelprojekte mit der Universität zu gewinnen.
Die Professur freut sich insbesondere auch über spontane Kontaktanfragen mit spannenden F&E-Ideen.
